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Biochimie structurale
Ce sont les notions classiques de la biochimie structurale de la première année et de la deuxième année de Licence (cursus LMD), ou anciennement DEUG mention Sciences de la Vie. Les différents documents (tous dans le format de fichier de type "pdf") correspondent à une enseignement d'environ 90h étudiant (cours, travaux dirigés).
1) L'eau
Sont abordées les propriétés physico-chimiques, ionisantes de l'eau. Un chapitre est consacré aux équilibres acido-basiques, à la force des acides et bases et aux courbes de titrage. Après avoir défini les solutions "tampon", de nombreux exemples et calculs de solution tampon sont explicités.
- Cours (32 pages) - Exercices (énoncés) - Eléments de réponse 2) Les glucides
Les propriétés physiques et chimiques des oses vous feront découvrir leur chiralité, la représentation de Fisher, leur structure cyclique et la représentation de Haworth. Les oligosides, polyosides homogènes et hétérogènes, les plus importants, constituent le dernier chapitre.
- Cours (36 pages) - Exercices (énoncés) - Eléments de réponse 3) Les lipides
Les lipides ont été regroupés en trois grandes catégories : les lipides vrais comprenant les acides gras, les lipides simples (acylglycérols, cérides, stérides), puis les lipides complexes regroupant les glycérophospholipides, les glycéroglycolipdes et les sphingolipides, et enfin les composés à caractère lipidique (lipoide), tels les dérivés de l'acide arachidonique, les terpènes et les composés terpéniques et enfin les stéroides.
- Cours (35 pages) - Exercices (énoncés) - Eléments de réponse 4) Les acides nucléiques
Une dizaine de pages décrivent les molécules de base (base, nucléoside, nucléotide) qui forment les acides nucléiques. Après la structure primaire des acides nucléiques (liaison phosphodiester essentiellement), les structures secondaires présentes dans l'ADN ou les ARN sont détaillées.
- Cours (29 pages) - Exercices (énoncés) - Eléments de réponse 5) Les aminoacides - protéines
Une vingtaine de pages sont consacrées aux aminoacides standard des protéines, à leurs propriétés chimiques, physiques, ioniques. Après les propriétés géométriques de la liaison peptidique, les propriétés chimiques et ioniques des peptides sont décrites. Une dizaine de pages traitent de la structure primaire et de la structure secondaire des protéines.
- Cours (51 pages) - Exercices (énoncés) - Eléments de réponse 6) Introduction à la cinétique enzymatique
Une vingtaine de pages sont consacrées à la cinétique enzymatique : les notions d'ordre de réaction, de catalyse sont abordées. Les modèles de cinétique enzymatique de Michaëlis-Menten et de Briggs-Haldane sont traités ave les significations des différentes constantes cinétiques classiques, ainsi que les diverses représentations graphiques utilisées en biochimie. Les notions d'activité, d'activité spécifique sont définies.
- Cours (21 pages) - Exercices (énoncés) - Eléments de réponse Compléments de détail
Des étudiants ont demandé une explication détaillée de quelques points abordés dans les cours ou les éléments de réponse, voici les plus significatifs :
- Calcul détaillé des propriétés remarquables de la courbe de titrage (eau, p 15) - Résolution détaillée (eau, p 22) - Correction détaillée de l'exercice n° 7 de l'eau - Détail du calcul des pourcentages des formes (protéines, p 31) - Correction détaillé de l'exercice n° 7 des protéines |